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HERRAMIENTA BIOINFORMÁTICA BAJO PERL Y LINUX, PARA LA DETERMINACIÓN DE PATRONES DE ADN, IMPLICADOS EN LA REGULACIÓN TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENES
(Universidad Santiago de cali, 2009) Pérez, Carlos Andrés
El presente artículo expone un programa elaborado en PERL y ejecutado bajo Linux, que permite extraer secuencias flanqueadoras de genes de genomas completos de procariotas y compararlas entre sí, con el objetivo de encontrar posibles secuencias comunes de unión a factores de transcripción (proteínas que regulan la transcripción luego de una translocación nuclear debido a una interacción específica con ADN o por una interacción estequiométrica con una proteína que puede unirse al complejo secuencia- ADN específico-proteína1). Los conjuntos de genes se han organizado a partir de experimentos de micro arreglos de ADN.