Caracterización del microbioma bacteriano de garrapatas que afectan a Canis lupus familiaris en diferentes sectores del municipio de Santiago de Cali

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dc.contributor.authorGiraldo Herrera, Jennifer Maria
dc.contributor.authorChicangana Piamba, Karen Daniela
dc.creator.degreeMédico Veterinario
dc.date.accessioned2026-10-23T20:20:40Z
dc.date.available2026-10-23T20:20:40Z
dc.date.issued2025-06-13
dc.descriptionLas garrapatas son ectoparásitos hematófagos que transmiten numerosos patógenos que afectan animales y humanos. En este sentido, esta investigación caracterizó el microbioma bacteriano de garrapatas que parasitan perros (Canis lupus familiaris) en diferentes sectores de Santiago de Cali, Colombia. Se recolectaron 160 garrapatas de 16 perros domésticos en diversos sectores urbanos y periurbanos. Mediante secuenciación de la región V3-V4 del gen 16S rRNA y análisis bioinformático. Se identificaron 95.000 lecturas crudas y después de proceso de limpieza quedaron 57.000 lecturas limpias, que revelaron una composición microbiana predominada por Streptomyces (familia Streptomycetaceae), Lactobacillus (familia Lactobacillaceae) y Sphingomonas (familia Sphingomonadaceae). Se observaron variaciones en la composición del microbioma entre garrapatas recolectadas en diferentes sectores, sugiriendo una influencia de factores ambientales y características del hospedador. Se detectó la presencia del género Erhlichia canis, con relevancia para la salud pública y veterinaria. Esta investigación representa el primer estudio del microbioma bacteriano de garrapatas en perros de Santiago de Cali, proporcionando información valiosa para comprender la ecología microbiana de estos vectores y su potencial implicación en la transmisión de enfermedades en esta región.
dc.description.abstractTicks are hematophagous ectoparasites that transmit numerous pathogens affecting animals and humans. This study characterized the bacterial microbiome of ticks that parasitize dogs (Canis lupus familiaris) in different areas of Santiago de Cali, Colombia. One hundred and sixty ticks were collected from 16 domestic dogs in various urban and peri-urban areas. The sequences were performed using the V3-V4 region of the 16S rRNA gene and bioinformatics analysis. Ninety-five thousand raw reads were identified, and after the cleaning process, 57,000 clean reads remained, revealing a microbial composition dominated by Streptomyces (family Streptomycetaceae), Lactobacillus (family Lactobacillaceae), and Sphingomonas (family Sphingomonadaceae). Variations in the microbiome composition were observed among ticks collected in different areas, suggesting an influence of environmental factors and host characteristics. The presence of the Candidatus genus Coxiella Mudrowiae was detected, with relevance to public and veterinary health. This research represents the first study of the bacterial microbiome of ticks on dogs in Santiago de Cali, providing valuable information for understanding the microbial ecology of these vectors and their potential involvement in disease transmission in this region.
dc.formatapplication/PDF
dc.format.extent22 Paginas
dc.identifier.urihttps://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/9853
dc.language.isoes
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicas
dc.publisher.programPrograma de Medicina Veterinaria
dc.pubplace.cityCali
dc.pubplace.stateValle del Cauca
dc.rights.accesoAcceso Abierto
dc.rights.ccReconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)
dc.source.institutionUniversidad Santiago de Cali
dc.source.repositoryRepositorio Institucional USC
dc.subject16S rRNA
dc.subjectCanis lupus familiaris
dc.subjectdiversidad microbiana
dc.subjectRhipicephalus sanguineus
dc.subjectsecuenciación masiva
dc.subjectvectores.
dc.subject.keywordCardona Tobar, Karen Melissa
dc.titleCaracterización del microbioma bacteriano de garrapatas que afectan a Canis lupus familiaris en diferentes sectores del municipio de Santiago de Cali
dc.type.spaInvestigación

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