Caracterización del microbioma bacteriano de garrapatas que afectan a Canis lupus familiaris en diferentes sectores del municipio de Santiago de Cali
Date
2025-06-13
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Abstract
Ticks are hematophagous ectoparasites that transmit numerous pathogens affecting animals and humans. This
study characterized the bacterial microbiome of ticks that parasitize dogs (Canis lupus familiaris) in different areas
of Santiago de Cali, Colombia. One hundred and sixty ticks were collected from 16 domestic dogs in various urban
and peri-urban areas. The sequences were performed using the V3-V4 region of the 16S rRNA gene and
bioinformatics analysis. Ninety-five thousand raw reads were identified, and after the cleaning process, 57,000
clean reads remained, revealing a microbial composition dominated by Streptomyces (family Streptomycetaceae),
Lactobacillus (family Lactobacillaceae), and Sphingomonas (family Sphingomonadaceae). Variations in the
microbiome composition were observed among ticks collected in different areas, suggesting an influence of
environmental factors and host characteristics. The presence of the Candidatus genus Coxiella Mudrowiae was
detected, with relevance to public and veterinary health. This research represents the first study of the bacterial
microbiome of ticks on dogs in Santiago de Cali, providing valuable information for understanding the microbial
ecology of these vectors and their potential involvement in disease transmission in this region.
Description
Las garrapatas son ectoparásitos hematófagos que transmiten numerosos patógenos que afectan animales y
humanos. En este sentido, esta investigación caracterizó el microbioma bacteriano de garrapatas que parasitan
perros (Canis lupus familiaris) en diferentes sectores de Santiago de Cali, Colombia. Se recolectaron 160
garrapatas de 16 perros domésticos en diversos sectores urbanos y periurbanos. Mediante secuenciación de la
región V3-V4 del gen 16S rRNA y análisis bioinformático. Se identificaron 95.000 lecturas crudas y después de
proceso de limpieza quedaron 57.000 lecturas limpias, que revelaron una composición microbiana predominada
por Streptomyces (familia Streptomycetaceae), Lactobacillus (familia Lactobacillaceae) y Sphingomonas (familia
Sphingomonadaceae). Se observaron variaciones en la composición del microbioma entre garrapatas
recolectadas en diferentes sectores, sugiriendo una influencia de factores ambientales y características del
hospedador. Se detectó la presencia del género Erhlichia canis, con relevancia para la salud pública y veterinaria.
Esta investigación representa el primer estudio del microbioma bacteriano de garrapatas en perros de Santiago
de Cali, proporcionando información valiosa para comprender la ecología microbiana de estos vectores y su
potencial implicación en la transmisión de enfermedades en esta región.
Keywords
16S rRNA, Canis lupus familiaris, diversidad microbiana, Rhipicephalus sanguineus, secuenciación masiva, vectores.