Composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico

Soto Rosales, Yabneel; Villanueva Villazón, Sarah Melissa

Composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico

dc.contributor.advisor	Duque Zapata, Juan Diego (Director)
dc.contributor.author	Soto Rosales, Yabneel
dc.contributor.author	Villanueva Villazón, Sarah Melissa
dc.creator.degree	Trabajo de Grado para optar al título de Microbióloga
dc.date.accessioned	2026-06-03T00:38:06Z
dc.date.available	2026-06-03T00:38:06Z
dc.date.issued	2025-12-04
dc.description	La contaminación de ecosistemas acuáticos por hidrocarburos es un problema ambiental significatitivo que afecta la biodiversidad y salud humana. El objetivo de este estudio fue determinar la composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico. Se analizaron 331 archivos de 6 países del repositorio MGnify del gen 16S rRNA; se utilizó SILVA y Kraken2 para la clasificación taxonómica y RStudio para los análisis de diversidad. Se identificaron 77 phylum, 551 familias y 1387 géneros bacterianos, con predominio de Proteobacteria y Desulfobacterota, taxones claves para la degradación del contaminante. Familias predominantes como Colwelliaceae demostraron un potencial biorremediador mediado por genes funcionales implicados en el proceso de degradación de hidrocarburos. Asimismo, se detectaron microorganismos no cultivables y bacterias con potencial patógeno. La metagenómica demostró su importancia en la comprensión de dinámicas ecológicas microbianas y su aplicación en estrategias con enfoque remediador.
dc.description.abstract	The contamination of aquatic ecosystems by hydrocarbons is a significant environmental problem that affects biodiversity and human health. The objective of this study was to determine the composition and structure of microbial communities associated with hydrocarbon-contaminated waters using a metagenomic approach. A total of 331 files from six countries in the MGnify repository of the 16S rRNA gene were analyzed; SILVA and Kraken2 were used for taxonomic classification and RStudio for diversity analysis. A total of 77 phyla, 551 families, and 1,387 bacterial genera were identified, with a predominance of Proteobacteria and Desulfobacterota, key taxa for pollutant degradation. Predominant families such as Colwelliaceae demonstrated bioremediation potential mediated by functional genes involved in the hydrocarbon degradation process. Likewise, uncultivable microorganisms and bacteria with pathogenic potential were detected. Metagenomics demonstrated its importance in understanding microbial ecological dynamics and its application in remediation strategies.
dc.format	application/pdf
dc.format.extent	20 páginas
dc.identifier.citation	Soto Rosales, Y., & Villanueva Villazón, S. M. (2025). Composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico. [Tesis de Pregrado, Universidad Santiago de Cali]. Repositorio Institucional USC.
dc.identifier.uri	https://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/9418
dc.language.iso	es
dc.publisher	Universidad Santiago de Cali
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias Básicas
dc.publisher.program	Microbiología
dc.pubplace.city	Cali
dc.pubplace.state	Valle del Cauca
dc.rights.acceso	Acceso Abierto
dc.rights.cc	Reconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.source.institution	Universidad Santiago de Cali
dc.source.repository	Repositorio Institucional USC
dc.subject	Metagenómica
dc.subject	Hidrocarburos
dc.subject	Diversidad microbiana
dc.subject	Biorremediación
dc.subject	Aguas contaminadas
dc.subject.keyword	Metagenomics
dc.subject.keyword	Hydrocarbons
dc.subject.keyword	Microbial diversity
dc.subject.keyword	Bioremediation
dc.subject.keyword	Contaminated water
dc.title	Composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico
dc.type	Thesis
dc.type.spa	Investigación