Bioprospección in silico de péptidos con actividad dual antibacteriana-cicatrizante
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Date
2022
Authors
Journal Title
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Publisher
Universidad Santiago de Cali
Abstract
Peptides are naturally produced by multiple organisms and exhibit a wide range of physiological, immunomodulatory, and wound healing functions. Additionally, they can provide protection against microorganisms, and they can be considered as an alternative antibiotic. To accelerate and aid the healing process, and avoid possible bacterial infections, peptides with dual antibacterial healing activity were identified from the cutaneous transcriptome of the Boana Pugnax frog (B. Pugnax) by in silico analysis. The peptides Alyteserin-2Ma, Brevenin-1Pb, Ocellatin-F1, Temporin-1P, Uperin 3.6, were selected based on their physicochemical properties and served as a template for their subsequent alignment with the B.Pugnax transcriptome, as well as their function as ligand with receptors EGF (Epithelial Growth Factor), VEGF (Vascular Epithelial Growth Factor), TGFβ-1 (Transforming Growth Factor Beta 1) and TGFβ-3 (Transforming Growth Factor Beta 3). The interactions between peptides and receptors were conducted by molecular docking analysis (Molecular Docking). The results revealed that Boana peptides can interact with receptors; Likewise, it was observed that most of these interactions exceeded the standard values (Boana Pugnax). Given these computational findings, new potentially effective antibacterial-healing peptides were identified for the healing process, which could be subsequently evaluated in in vitro tests.
Description
Los péptidos son producidos naturalmente por múltiples organismos y exhiben una amplia gama de funciones fisiológicas, inmunomoduladoras y de cicatrización de heridas. Adicionalmente, pueden proporcionar protección contra microorganismos y que pueden ser considerados como un antibiótico alternativo. Para acelerar y ayudar en el proceso de cicatrización, y evitar las posibles infecciones por bacterias, se identificaron péptidos con actividad dual antibacteriana-cicatrizante del transcriptoma cutáneo de la rana Boana Pugnax (B. Pugnax) mediante el análisis in silico. Los péptidos Alyteserin-2Ma, Brevenin-1Pb, Ocellatin-F1, Temporin-1P, Uperin 3.6, se seleccionaron en función de sus propiedades fisicoquímicas y sirvieron como plantilla para su posterior alineamiento con el transcriptoma de B.Pugnax, así como su función como ligando con los receptores EGF (Factor de crecimiento epitelial), VEGF (Factor de crecimiento epitelial vascular), TGFβ-1 (Factor de crecimiento transformante Beta 1) y TGFβ-3 (Factor de crecimiento transformante Beta 3). Las interacciones entre los péptidos y los receptores se realizaron mediante análisis de acoplamiento molecular (Docking Molecular). Los resultados revelaron que los péptidos Boana tienen la capacidad de interactuar con receptores; así mismo se observó que en su mayoría, estas interacciones superaban los valores estándar, es decir los alores encontrados durante el acoplamiento molecular (Boana Pugnax). Dados estos hallazgos computacionales, se identificaron nuevos péptidos antibacterianos-cicatrizantes potencialmente efectivos para el proceso de cicatrización, los cuales, podrán ser evaluados posteriormente en ensayos in vitro.
Keywords
Péptidos antibacterianos, Péptidos cicatrizantes, Boana Pugnax
Citation
Fernández Bedoya, I. (2022). Bioprospección in silico de péptidos con actividad dual antibacteriana-cicatrizante. Universidad Santiago de Cali.