Caracterización genética de aislados de Vibrio metschnikovii resistentes a antibióticos provenientes de una planta de tratamiento de lixiviados ubicada en Cali
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Date
2022
Authors
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Publisher
Universidad Santiago de Cali
Abstract
Vibrio metschnikovii is a Gram-negative bacillus that inhabits aquatic environments, including leachates, which are formed from the percolation of waste deposited in landfills. And that due to the high load of contaminants generate a selective pressure on bacteria, leading them to acquire extragenic elements such as plasmids that are disseminated from one bacterium to another through horizontal gene transfer, giving them characteristics that allow them to survive in adverse environments. Due to the high prevalence of V. metschnikovii isolates resistant to antibiotics in one of the lagoons without physicochemical treatment of a Leachate Treatment Plant, located in the municipality of Santiago de Cali, genetic characterization of these isolates was carried out in this work, with the objective of determining the genetic diversity of each one of the isolates. For this purpose, the isolates were genotyped by amplifying the extragenic palindromic repetitive sequences through the polymerase chain reaction (rep-PCR). Additionally, it was determined whether the isolates carried plasmids and whether they had the ability to transfer horizontally. The results indicate that, although rep sequences are found in a wide variety of bacteria, V. metschnikovii does not have them. For this reason, it is suggested that pulsed-field gel electrophoresis studies be carried out to determine the genetic relationship between bacterial isolates. Additionally, it was possible to purify plasmid DNA in an amikacin-resistant isolate, which cannot be transferred by conjugation.
Description
Vibrio metschnikovii es un bacilo Gram negativo que habita en ambientes acuáticos, incluyendo lixiviados, los cuales se caracterizan por tener una carga de contaminantes elevada que generan una presión selectiva sobre las bacterias que allí habitan. Esto a su vez favorece que puedan adquirir elementos extracromosómicos como los plásmidos que se pueden diseminar de una bacteria a otra a través de la transferencia horizontal de genes, confiriéndoles características que les permiten sobrevivir en este tipo de ambientes. Debido a que se ha determinado una prevalencia alta de aislados de V. metschnikovii resistentes a antibióticos en una de las lagunas sin tratamiento fisicoquímico de una Planta de Tratamiento de Lixiviados, ubicada en el municipio Santiago de Cali, en este trabajo se realizó la caracterización genética de los mismos. Inicialmente, se realizó la genotipificación de los aislados amplificando las secuencias palindrómicas extragénicas repetitivas a través de la reacción en cadena de la polimerasa (rep-PCR). Adicionalmente, se determinó si los aislados eran portadores de plásmidos y si contaban con la capacidad de transferirse de forma horizontal. Los resultados indican que, aunque las secuencias rep se encuentran en una gran variedad de bacterias, V. metschnikovii no cuenta con estas. Por este motivo se sugiere realizar estudios de electroforesis de gel de campo pulsado con el objetivo de determinar la relación genética entre los aislados bacterianos. Adicionalmente, se logró purificar ADN plasmídico en un aislado resistente a amikacina, que no puede ser transferido por conjugación.
Keywords
Vibrio metschnikovii, Transferencia horizontal, Lixiviados, Resistencia, Antibióticos, Genotipificación
Citation
Zúñiga Espitia, C. (2022). Caracterización genética de aislados de Vibrio metschnikovii resistentes a antibióticos provenientes de una planta de tratamiento de lixiviados ubicada en Cali. Universidad Santiago de Cali.