Análisis estructural y supramolecular del compuesto (e)-3',6'-dihidroxi-2-((pyridina-2-yl metileno) amino) spiro[isoidolina-1,9'-xanteno]-3-ona
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Date
2019
Authors
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Publisher
Universidad Santiago de Cali
Abstract
The crystalline structure of the compound (E) -3 ',6'-dihydroxy-2-((pyridine-2-and methylene) amino) spiro [iso-idoline-1,9'-xanthene] -3-one was solved and refined, using single crystal X-ray diffraction data. It was found that the compound crystallized in the triclinic P-1 space group. its unit cell present two molecules per asymmetric unit, which correspond to molecular conformers. Moreover, an analysis to determine the intermolecular interactions from the crystalline system was performed. It was observed that the crystal packing is formed mainly by hydrogen interactions type O-H••• N, and C-H•••O. Finally, the supramolecular interactions of the dimer were quantified using fingerprint plots, obtaining values of 41.4%, 12.9%, 11.1% and 10.4% for interactions type H•••H, C•••H, O•••H, H•••C respectively. The aforementioned diagrams were compared with the obtained for structurally similar molecules; their forms confirmed the differences at the supramolecular level of the compounds analyzed. With this project, it was possible to determine the structural and supramolecular characteristics of the compound. In addition, were acquired the basic concepts related to crystallography and supramolecular chemistry, both at a theoretical and experimental level.
Description
En este trabajo fue resuelta la estructura cristalina del compuesto (E)-3',6'-dihidroxi-2-((pyridina-2-yl metileno) amino) spiro[isoidolina-1,9'-xanteno]-3-ona, utilizando datos de difracción de rayos X de monocristal. Se encontró que la molécula cristaliza en el grupo espacial triclínico P-1 y dentro de su celda unidad hay dos moléculas por unidad asimétrica, las cuales corresponden a confórmeros moleculares. Se encontró un desorden posicional en el confórmero II y se llevó a cabo su modelamiento para determinar un perfil de energía conformacional con el fin de explicar el motivo del desorden observado. Además, se realizó el análisis supramolecular para determinar las interacciones intermoleculares que estabilizan el empaquetamiento cristalino. Se observó que el empaquetamiento cristalino es dado principalmente por interacciones de hidrógeno, tipo O-H…N, y C-H…O. Por último, para el dímero se cuantificaron las interacciones supramoleculares usando diagramas de huellas dactilares, obteniendo valores de 41.4%,12.9%,11.1% y 10.4% para interacciones tipo H…H, C…H, O…H, H…C respectivamente. Dichos diagramas se compararon con los obtenidos para moléculas estructuralmente similares, donde sus formas confirmaron las diferencias a nivel supramolecular de los compuestos analizados. Con este trabajo, se pudo determinar las características estructurales y supramoleculares del compuesto. Además, se adquirió formación relacionada con los conceptos básicos de cristalografía y química supramolecular, tanto a nivel teórico como experimental.
Keywords
Estructura cristalina, Difracción de rayos X, Análisis supramolecular, Interacciones moleculares, Diagramas de huellas dactilare
Citation
Cardona Restrepo, C. (2019). Análisis estructural y supramolecular del compuesto (e)-3’,6’-dihidroxi-2-((pyridina-2-yl metileno) amino) spiro[isoidolina-1,9’-xanteno]-3-ona. Universidad Santiago de Cali.
Giraldo, María, C. E. (2019). Correlación instrumental y sensorial de la calidad de una muestra de yogurt de la empresa fructilacteos. Universidad Santiago de Cali.
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