Aproximación metagenómica para la identificación de bacterias endófitas de la raíz de yuca (manihot esculenta crantz) bajo condiciones de estrés abiótico

Fernández Gaviria, Alexandra; Herrera Arbeláez, Valentina

Aproximación metagenómica para la identificación de bacterias endófitas de la raíz de yuca (manihot esculenta crantz) bajo condiciones de estrés abiótico

dc.contributor.advisor	Corrales Ducuara, Alba Rocío
dc.contributor.author	Fernández Gaviria, Alexandra
dc.contributor.author	Herrera Arbeláez, Valentina
dc.creator.degree	Trabajo de grado para optar al título profesional en Microbiología
dc.date.accessioned	2020-10-24T14:02:31Z
dc.date.available	2020-10-24T14:02:31Z
dc.date.issued	2020
dc.description	La yuca (M. esculenta) es el cuarto cultivo más importante a nivel mundial. Es considerado un alimento básico en la dieta de millones de personas en áreas tropicales y subtropicales del mundo. Sin embargo, su productividad se ha visto afectada a causa de condiciones ambientales adversas como; las altas y bajas temperaturas. En este sentido, es importante estudiar nuevos mecanismos de tolerancia a diferentes tipos de estrés abiótico. Conocer la diversidad microbiana endófita de la raíz puede influir de manera positiva o negativa en el desarrollo, productividad y salud del cultivo bajo condiciones de estrés abiótico. Plantas de yuca (M. esculenta) variedad MCOL1734 fueron sometidas a estrés por déficit hídrico por un periodo de 20 días. El análisis metagenómico de comunidades endófitas permitió identificar cuatro Phylum; Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes y Actinobacteria, los cuales son catalogados como endófitos en raíz de plantas. Especies como; Clostridium sp. Acinetobacter lwoffii y Acinetobacter sp. las cuales son bacterias promotoras de crecimiento vegetal (PGPR), son candidatas para implementar en programas de mejora para aumentar la tolerancia al déficit hídrico en el cultivo de la yuca (M. esculenta).	en_US
dc.description.abstract	Cassava (M. esculenta) is the fourth most important crop in the world. It is considered a basic food in the diet of millions of people in tropical and sub-tropical areas. However, its productivity has been affected by adverse environmental conditions such as: low and high temperatures. In this regard, it is important to study new tolerant mechanisms to different types of abiotic stress. Knowing the endophyte microbial diversity of the root may influence positively or negatively in its development, productivity and crop heath under abiotic stress conditions. Cassava plants M. esculenta of the variety MCOL1734 were subjected to stress by hydric deficit for a 20-day period. In the metagenomic analysis of endophyte bacteria there were four Phylum; Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and Actinobacteria, which are cataloged as endophytes in root of plants. Species like; Clostridium sp. Acinetobacter lwoffii and Acinetobacter sp. which are PGPR bacteria, are candidates to implement in improvement programs to increase tolerance to water deficit in cassava cultivation (M. esculenta).	en_US
dc.format	application/pdf
dc.format.extent	24 páginas
dc.identifier.citation	Fernández Gaviria, Alexandra; Herrera Arbeláez, V. (2020). Aproximación metagenómica para la identificación de bacterias endófitas de la raíz de yuca (manihot esculenta crantz) bajo condiciones de estrés abiótico. Universidad Santiago de Cali.	en_US
dc.identifier.uri	http://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/4540
dc.language.iso	es	en_US
dc.publisher	Universidad Santiago de Cali	en_US
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias Básicas
dc.publisher.program	Microbiología
dc.pubplace.city	Cali
dc.pubplace.state	Valle del Cauca
dc.rights.acceso	Acceso Abierto
dc.rights.cc	Reconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.source.institution	Universidad Santiago de Cali
dc.source.repository	Repositorio Institucional USC
dc.subject	Manihot Esculenta	en_US
dc.subject	Yuca	en_US
dc.subject	Metagenómica	en_US
dc.subject	Endófitas	en_US
dc.subject	Estrés Abiótico	en_US
dc.subject	PGPR	en_US
dc.title	Aproximación metagenómica para la identificación de bacterias endófitas de la raíz de yuca (manihot esculenta crantz) bajo condiciones de estrés abiótico	en_US
dc.type	Thesis	en_US
dc.type.spa	Articulo