Identificación molecular de levaduras pertenecientes a la micoteca de la universidad Santiago de Cali, Colombia
No Thumbnail Available
Date
2022
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad Santiago de Cali
Abstract
The Mycology Research Group at Universidad Santiago de Cali has a bank of yeast strains isolated from different environments in the department of Valle del Cauca. Of a total of 285 deposited strains, only 109 had taxonomic identification at the genus and / or species level. The aim of this study was to identify yeast strains deposited in the USC fungal library, previously isolated from aquatic ecosystems and foods in Cali. For that, strains were verified according to their macroscopic and microscopic morphology and sequences of the ITS (Internal Transcribed Spacer) were obtained. In cases where ITS amplification was not obtained the D1 / D2 domain of the large ribosomal subunit (LSU) was used. The genera that were identified were: Rhodotorula, Yarrowia, Candida, Pichia, Hanseniaspora, Naganishia and Torulaspora. According to the results, the protocols used allowed enriching the identification of genera and/or species of yeasts belonging to the USC mycoteca. In addition, a new taxonomic record for Valle del Cauca (genus Naganishia) was detected, which demonstrates the importance of this type of collections for diversity in Colombia
Description
La Universidad Santiago de Cali (USC) cuenta con un banco de cepas de levaduras aisladas de diferentes ambientes en el departamento del Valle del Cauca. De un total de 285 cepas depositadas, solamente 109 cuentan con identificación taxonómica a nivel de género y/o especie. El objetivo de este estudio fue identificar las cepas de levaduras, depositadas en la micoteca USC, aisladas previamente de sistemas acuáticos y alimentos de la ciudad de Cali. Para ello, las cepas se verificaron de acuerdo con su morfología macroscópica y microscópica y se obtuvieron secuencias de la región ITS (Espaciador transcrito interno). En los casos donde no se obtuvo amplificación ITS se utilizó el dominio D1/D2 de la subunidad grande ribosomal (LSU). Los géneros que se identificaron fueron: Rhodotorula, Yarrowia, Candida, Pichia, Hanseniaspora, Naganishia y Torulaspora. De acuerdo con los resultados, los protocolos utilizados permitieron enriquecer la identificación de géneros y/o especies de levaduras pertenecientes a la micoteca de la USC. Además, se identificó un nuevo registro taxonómico para el Valle del Cauca (género Naganishia), lo cual muestra la importancia de este tipo de colecciones para la diversidad en Colombia
Keywords
Cepario, Región ITS, D1/D2, Biodiversidad, Taxonomía, Levaduras
Citation
Bados López, María Camila; González Murillas, J. J. (2022). Identificación molecular de levaduras pertenecientes a la micoteca de la universidad Santiago de Cali, Colombia. UNiversidad Santiago de Cali