Bacterias ambientales aisladas en Santiago de Cali: una aproximación desde la taxonomía integrativa

Vergara López, Laura Isabella; Ortiz Díaz, Alejandro

Bacterias ambientales aisladas en Santiago de Cali: una aproximación desde la taxonomía integrativa

dc.contributor.advisor	Rosero García, Doris Amanda (Directora)
dc.contributor.author	Vergara López, Laura Isabella
dc.contributor.author	Ortiz Díaz, Alejandro
dc.creator.degree	Trabajo de Grado para optar al título de Microbiólogo
dc.date.accessioned	2025-04-03T16:57:19Z
dc.date.available	2025-04-03T16:57:19Z
dc.date.issued	2020
dc.description	La taxonomía integrativa se define como el uso de una perspectiva múltiple y complementaria para la delimitación de especies. En el presente estudio se aislaron bacterias cultivables de seis lagunas que hacen parte de una planta de tratamiento de lixiviados ubicada en el Antiguo Vertedero de Navarro. Para cada uno de los aislamientos se obtuvieron caracteres de taxonomía bacteriana tradicional para la identificación de morfotipos y caracteres ecológicos para la determinación de ecotipos. Luego, para algunos aislamientos se obtuvieron caracteres moleculares mediante la amplificación de la subunidad ribosomal de ARNr 16S, caracteres obtenidos de pruebas bioquímicas o MALDI-TOF, los cuáles fueron caracteres adicionales. Se diseñó un protocolo de taxonomía integrativa, el cual permitió la asignación de una categoría taxonómica utilizando caracteres de taxonomía convencional, caracteres moleculares (ARNr 16S) y uno de los caracteres adicionales. Se generó una lista conformada por: 26 especies descritas, 25 especies candidatas confirmadas y 3 especies candidatas no confirmadas. El desarrollo de esta investigación contribuye con el conocimiento sobre la biodiversidad de bacterias a nivel local y nacional, se actualiza el listado de especies de bacterias ambientales en 242. Además, se implementó una metodología que hasta la fecha no había sido utilizada para la identificación de bacterias con interés ambiental en Colombia.
dc.description.abstract	Integrative taxonomy is defined as the use of a multiple and complementary perspective for the delimitation of species. In the present study, culturable bacteria were isolated from six lagoons that are part of a landfill leachate treatment plant located at Antiguo Vertedero of Navarro. For each of the isolates, traditional bacterial taxonomic characters were obtained for the identification of morphotypes and ecological characters for the determination of ecotypes. Then, for some isolates, molecular characters were obtained by amplifying the ribosomal subunit of 16S rRNA, characters obtained from biochemical tests or MALDI-TOF, which were additional characters. An integrative taxonomy protocol was designed, which allowed the assignment of a taxonomic category using characters from conventional taxonomy, molecular characters (16S rRNA) and one of the additional characters. A list was generated consisting of 26 described species, 25 confirmed candidate species and 3 unconfirmed candidate species. The development of this research contributes to the knowledge about the biodiversity of bacteria at the local and national level, the list of species of environmental bacteria in Colombia is updated to 242. In addition, a methodology that had not been used to date for the identification of bacteria with environmental interest in Colombia was implemented.
dc.format	application/pdf
dc.format.extent	57 páginas
dc.identifier.citation	Vergara López, Laura Isabella; Ortiz Díaz, A. (2020). Bacterias ambientales aisladas en Santiago de Cali: Una aproximación desde la taxonomía Integrativa. Universidad Santiago de Cali.
dc.identifier.uri	https://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/6224
dc.language.iso	es
dc.publisher	Universidad Santiago de Cali
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias Básicas
dc.publisher.program	Microbiología
dc.pubplace.city	Cali
dc.pubplace.state	Valle del Cauca
dc.rights.acceso	Acceso Privado
dc.rights.cc	Reconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.source.institution	Universidad Santiago de Cali
dc.source.repository	Repositorio Institucional USC
dc.subject	Antiguo Vertedero de Navarro
dc.subject	Bacterias ambientales
dc.subject	Planta de Tratamiento de Lixiviados
dc.subject	Taxonomía integrativa
dc.subject.keyword	Environmental bacteria
dc.subject.keyword	Integrative taxonomy
dc.subject.keyword	Leachate Treatment Plant
dc.title	Bacterias ambientales aisladas en Santiago de Cali: una aproximación desde la taxonomía integrativa
dc.type	Thesis
dc.type.spa	Trabajo de Grado