Caracterización in-silico del gen omp28 de Brucella abortus. con potencial aplicación en la vigilancia epidemiológica de la brucelosis bovina
| dc.contributor.author | Pizo Gómez, Andrés Felipe | |
| dc.date.accessioned | 2026-02-12T00:27:47Z | |
| dc.date.available | 2026-02-12T00:27:47Z | |
| dc.date.issued | 2025-12-09 | |
| dc.description | Las enfermedades bovinas afectan la producción alimenticia y la economía a nivel mundial. En Colombia, las enfermedades infecciosas como la Aftosa, la brucelosis y la anaplasmosis causan enormes pérdidas económicas que superan los miles de millones y deterioran la calidad de vida de productores y animales. Detectar estas enfermedades infecciosas a tiempo permitiría tener comunidades y granjas más sanas con animales, productores y consumidores más sanos. La seguridad alimentaria, uno de los pilares de la sostenibilidad, depende de estrategias que mitiguen el impacto de estas enfermedades. El objetivo de este proyecto fue desarrollar una caracterización In-Silico del gen Omp28 de Brucella abortus para evaluar su potencial como marcador diagnóstico aplicable a la vigilancia epidemiológica de la brucelosis bovina. Se emplearon herramientas bioinformáticas: BLASTx, InterProScan, SignalP, TMHMM, alineamientos en MEGA/Jalview, WebLogo, modelado estructural (SWISS-MODEL y AlphaFold), análisis de interacción (STRING), diseño de primers (Primer3Plus) y predicción de epítopos (IEDB). Se identificó un péptido señal Sec/SPI (clivaje 28–29), dominios conservados (IPR052022, DUF541), alta identidad con especies del género Brucella (hasta 99–99.6 %), posibles sitios de glicosilación y fosforilación (destacando Thr67 y Thr131) y epítopos B prometedores (149–171; 202–236). El modelado mostró métricas de calidad satisfactorias (GMQE/QMEANDisCo). Se concluye que Omp28 es un antígeno conservado e inmunogénico con aplicabilidad potencial en herramientas moleculares para vigilancia, sujeto a validación experimental. Este proyecto demuestra la gran utilidad de aplicar herramientas bioinformáticas a los estudios epidemiológicos y a predecir las rutas experimentales que validen los hallazgos con el mínimo de recursos económicos invertidos. Mas aun, esta información servirá para extrapolar estos análisis a otras infecciones de comportamiento biológico similar o a permitir la identificación temprana de agentes contaminantes de brucelosis bovina en otras regiones del país e incluso del continente. | |
| dc.description.abstract | Bovine diseases have a significant impact on food production and the global economy. In Colombia, infectious diseases such as foot-and-mouth disease, brucellosis, and anaplasmosis cause substantial economic losses amounting to billions of dollars, while also negatively affecting the welfare of both animals and producers. Early detection of these infections is essential for fostering healthier livestock systems, benefiting animals, farmers, and consumers alike. Food security—one of the fundamental pillars of sustainability—relies heavily on effective strategies to mitigate the impact of such diseases. The objective of this project was to characterize the Omp28 gene of Brucella abortus through In-Silico analyses in order to assess its potential as a diagnostic marker for the epidemiological surveillance of bovine brucellosis. A range of bioinformatics tools was employed, including BLASTx, InterProScan, SignalP, TMHMM, sequence alignments in MEGA/Jalview, WebLogo, structural modeling using SWISS-MODEL and AlphaFold, protein–protein interaction analysis via STRING, primer design with Primer3Plus, and epitope prediction using the IEDB platform. The analyses identified a Sec/SPI signal peptide (cleavage site between positions 28–29), conserved domains (IPR052022, DUF541), and a high degree of sequence identity with other Brucella species (99–99.6%). Additionally, potential glycosylation and phosphorylation sites were detected, with Thr67 and Thr131 being particularly notable. Promising B-cell epitopes were identified in regions 149–171 and 202–236. Structural modeling yielded satisfactory quality scores (GMQE/QMEANDisCo), supporting the reliability of the predicted protein structure. These findings suggest that Omp28 is a conserved and immunogenic antigen with strong potential for application in molecular surveillance tools, pending experimental validation. This study highlights the value of integrating bioinformatics approaches into epidemiological research, enabling the prediction of experimental strategies that can validate In-Silico findings with minimal financial investment. Furthermore, the information generated can be extrapolated to other infectious agents with similar biological characteristics and may support the early detection of bovine brucellosis in differ ent regions of Colombia and potentially across the continent. | |
| dc.identifier.citation | Pizo Gómez, A. F. (2025). Caracterización In-Silico del gen OMP28 de Brucella abortus con potencial aplicación en la vigilancia epidemiológica de la brucelosis bovina [Tesis de pregrado, Universidad Santiago de Cali]. Repositorio Institucional USC. | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/9154 | |
| dc.language.iso | es | |
| dc.publisher | Universidad Santiago de Cali | |
| dc.subject | Brucella abortus | |
| dc.subject | OMP28 | |
| dc.subject | análisis in silico | |
| dc.subject | caracterización genética | |
| dc.subject | bioinformática | |
| dc.subject | vigilancia epidemiológica | |
| dc.subject | brucelosis bovina | |
| dc.title | Caracterización in-silico del gen omp28 de Brucella abortus. con potencial aplicación en la vigilancia epidemiológica de la brucelosis bovina | |
| dc.type | Thesis |
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