Estudio estructural y supramolecular por medio de difraccion de rayos x y superficies de hirshfeld del compuesto ácido 2-(e)-((4-hidroxifenil) diazenil) benzoico
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Date
2019
Authors
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Publisher
Universidad Santiago de Cali
Abstract
The crystalline structure of 2-(E)-((4-hydroxyphenyl) diazenil) benzoic acid compound, was resolved by means of the intrinsic phase method using single-crystal X-ray diffraction data. It was find that the molecule crystallizes in the ortorombic crystalline system with Pbca space group. Within its unit cell there are four molecules per asymmetric unit, which are molecular conformers and form beta helix arrangement along [0 1 0] direction. Hirshfeld surface calculation was performed to determine the intermolecular interactions that contribute the most to crystalline packaging. It was possible to observe that the main contribution to the general surface is given by the contacts H…H (34.8%), followed by interactions O…H/H…O (27%) and C…H/H…C (18.6%). The energy interaction networks were calculated at a HF/3-2 level, allowing to quantify the high participation of dispersion interactions (-57.5 kJ/mol) in the formation of crystalline packaging.
Keywords: crystallography, Hirshfeld surfaces, X ray, cell unit, intrinsic phase
Description
La estructura cristalina del compuesto ácido 2-(E)-((4-hidroxifenil) diazenil) benzoico, se resolvió por medio del método de fase intrínseca usando datos de difracción de rayos X de monocristal, encontrando que la molécula cristaliza en el sistema cristalino ortorrómbico con grupo espacial Pbca. Dentro de su celda unidad hay cuatro moléculas por unidad asimétrica, las cuales son confórmeros moleculares. Estos conformeros forman hélices beta a lo largo de la dirección [0 1 0]. A partir de los datos estructurales se realizó el cálculo de superficies de Hirshfeld determinando a partir de los diagramas de huellas dactilares bidimensionales las interacciones intermoleculares que más contribuyen al empaquetamiento cristalino. Se pudo determinar que la principal contribución a la superficie general se da por los contactos H···H (34,8%), seguida de interacciones O···H/H···O (27%) y C···H/H···C (18,6%). También fueron calculadas las redes energéticas de interacción con un nivel de teoría HF/3-21G, permitiendo cuantificar la alta participación de interacciones de dispersión (-57,5 kJ/mol) en la formación del empaquetamiento cristalino
Keywords
Cristalografía, Superficies de Hirshfeld, Rayos X, Celda Unidad, Fase Intrínseca
Citation
García Carreño, C. A. (2019). Estudio estructural y supramolecular por medio de difraccion de rayos x y superficies de hirshfeld del compuesto ácido 2-(e)-((4-hidroxifenil) diazenil) benzoico. Universidad Santiago de Cali.