Duque Zapata, Juan Diego (Director)Soto Rosales, YabneelVillanueva Villazón, Sarah Melissa2026-06-032026-06-032025-12-04Soto Rosales, Y., & Villanueva Villazón, S. M. (2025). Composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico. [Tesis de Pregrado, Universidad Santiago de Cali]. Repositorio Institucional USC.https://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/9418La contaminación de ecosistemas acuáticos por hidrocarburos es un problema ambiental significatitivo que afecta la biodiversidad y salud humana. El objetivo de este estudio fue determinar la composición y estructura de comunidades microbianas asociadas a aguas contaminadas con hidrocarburos mediante un enfoque metagenómico. Se analizaron 331 archivos de 6 países del repositorio MGnify del gen 16S rRNA; se utilizó SILVA y Kraken2 para la clasificación taxonómica y RStudio para los análisis de diversidad. Se identificaron 77 phylum, 551 familias y 1387 géneros bacterianos, con predominio de Proteobacteria y Desulfobacterota, taxones claves para la degradación del contaminante. Familias predominantes como Colwelliaceae demostraron un potencial biorremediador mediado por genes funcionales implicados en el proceso de degradación de hidrocarburos. Asimismo, se detectaron microorganismos no cultivables y bacterias con potencial patógeno. La metagenómica demostró su importancia en la comprensión de dinámicas ecológicas microbianas y su aplicación en estrategias con enfoque remediador.The contamination of aquatic ecosystems by hydrocarbons is a significant environmental problem that affects biodiversity and human health. The objective of this study was to determine the composition and structure of microbial communities associated with hydrocarbon-contaminated waters using a metagenomic approach. A total of 331 files from six countries in the MGnify repository of the 16S rRNA gene were analyzed; SILVA and Kraken2 were used for taxonomic classification and RStudio for diversity analysis. A total of 77 phyla, 551 families, and 1,387 bacterial genera were identified, with a predominance of Proteobacteria and Desulfobacterota, key taxa for pollutant degradation. Predominant families such as Colwelliaceae demonstrated bioremediation potential mediated by functional genes involved in the hydrocarbon degradation process. Likewise, uncultivable microorganisms and bacteria with pathogenic potential were detected. Metagenomics demonstrated its importance in understanding microbial ecological dynamics and its application in remediation strategies.application/pdf20 páginasesMetagenómicaHidrocarburosDiversidad microbianaBiorremediaciónAguas contaminadasThesisAcceso AbiertoReconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)MetagenomicsHydrocarbonsMicrobial diversityBioremediationContaminated water