Rivera, Sandra PatriciaOcampo Ibáñez, Iván DaríoMéndez Banguera, Angelica MaríaTarapues Mahecha, Angee Lorena2025-09-172025-09-172023Méndez Banguera, Angelica María; Tarapues Mahecha, A. L. (2023). Identificación del Resistoma y viruloma de aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa multirresistente. Universidad Santiago de Calihttps://repositorio.usc.edu.co/handle/20.500.12421/8146Pseudomonas aeruginosa es un microorganismo de gran importancia clínica cuya fisiología le confiere amplia resistencia a los antimicrobianos, y que en los últimos años ha adquirido mecanismos de resistencia y virulencia que dificultan el tratamiento de las infecciones disminuyendo las opciones terapéuticas. La compleja situación con esta bacteria ha aumentado el interés en la búsqueda de alternativas para controlar la diseminación de cepas multirresistentes enfatizando en el estudio de su genoma. El objetivo principal de esta investigación fue la identificación de los genes de resistencia a antimicrobianos intrínsecos y adquiridos de tres cepas aisladas de clínica de P. aeruginosa multirresistente, cuyos genomas fueron evaluados por medio de una serie de análisis bioinformáticos con el fin de determinar los genes responsables de conferir resistencia a antibióticos del tipo betalactámicos, incluyendo los antibióticos carbapenémicos utilizados comúnmente para tratar las infecciones causados por P. aeruginosa. Se realizó la anotación del genoma completo de los aislados seguido por el alineamiento de los genes de betalactamasas encontradas, con el fin de establecer la relación de los genes hallados por medio de bioinformática con los anteriormente encontrados en el laboratorio durante un estudio previo, así como su relación con otras cepas reportadas como multirresistentes. Se identificaron también factores de virulencia relacionados con la patogenicidad de Pseudomonas aeruginosa multirresistente con el objetivo de conocer su comportamiento e importancia en este tipo de microorganismos. Se tomaron en cuenta únicamente los genes categorizados como resistentes a antibióticos, el resto de los genes resistentes a antimicrobianos incluyendo desinfectantes y bactericidas químicos fueron descartados. Se encontraron 15 genes de resistencia adquiridos, de los cuales el 33.33% (5/15) corresponden a enzimas betalactamasas de diferentes clases, el 40% (6/15) a enzimas de resistencia a aminoglucósidos y, por último, el 26.67% (4/15) de genes responsables de conferir resistencia a fluoroquinolonas. La comparación se realizó de acuerdo con la cepa de referencia Pseudomonas aeruginosa PAO1. Lo más significativo que se encontró durante la clasificación fue la presencia de los genes de resistencia de la familia VIM, responsables de codificar la enzima betalactamasa de clase B blaVIM-2 hallada tanto en las pruebas de laboratorio como en la anotación del genoma de las tres cepas aisladas. Adicionalmente, se encontraron 26 genes de resistencia intrínsecos donde el 7,69% (2/31) fueron enzimas betalactamasas, mientras que el 30.77% (8/31) correspondió los complejos formadores de bombas de expulsión. El 61.54% (16/26) restante se compuso por otros genes tales como gyrA, gyrB, aph(3”)-llb, gibB, rpoC,PgsA,murA, fosA, folA, Arl, entre otros, distribuidos entre las diferentes familias de antibióticos. Finalmente, en los factores de virulencia se identificaron mecanismos de acción de Adherencia, endotoxina (Waap), motilidad (fleN, FliD, fleQ, fliC, FlhB, fliP, fleR, flgL, pilX, pilU), biofilm (algA, algJ, algD, algZ, algF,algU, algR), sistema de secreción tipo ll (LasA , LasB), sistema de secreción tipo III (exoS, exoT, exoY) y proteasa (AprA), afirmando lo descrito en la literatura sobre P. aeruginosa, donde se cataloga como un microorganismo multifactorial y cuyos mecanismos deben ser estudiados a profundidad puesto que son de gran relevancia en el área de la saludPseudomonas aeruginosa is a microorganism of great clinical importance that has a physiology that gives it extensive resistance to antimicrobials, and that in recent years has acquired resistance and virulence mechanisms that make the treatment of infections difficult, reducing therapeutic options. The complex situation with this bacteria has increased interest in the search for alternatives to control the dissemination of multiresistant strains, emphasizing the study of its genome. The main objective of this research was the identification of the intrinsic and acquired antimicrobial resistance genes of three clinically isolated strains of multidrug-resistant P. aeruginosa, whose genomes were evaluated through a series of bioinformatic analyzes in order to determine the genes responsible for conferring resistance to beta-lactam type antibiotics. The annotation of the complete genome of the isolates was carried out followed by the alignment of the beta-lactamase genes found, in order to establish the relationship of the genes found through bioinformatics with those previously found in the laboratory during a previous study, as well as its relationship with other strains reported as multiresistant. Virulence factors related to the pathogenicity of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa were also identified with the aim of understanding its behavior and importance in this type of microorganisms. Only genes categorized as antibiotic resistant were taken into account; the rest of the genes resistant to antimicrobials, including disinfectants and chemical bactericides, were discarded. 15 acquired resistance genes were found, of which 33.33% (5/15) correspond to beta-lactamase enzymes of different classes, 40% (6/15) to aminoglycoside resistance enzymes and, finally, 26.67% ( 4/15) of genes responsible for conferring resistance to fluoroquinolones. The comparison was performed according to the reference strain Pseudomonas aeruginosa PAO1. The most significant thing that was found during the classification was the presence of the resistance genes of the VIM family, responsible for encoding the class B beta-lactamase enzyme blaVIM-2 found both in the laboratory tests and in the annotation of the genome of the three isolated strains. Additionally, 26 intrinsic resistance genes were found where 7.69% (2/31) were beta-lactamase enzymes, while 30.77% (8/31) corresponded to efflux pump-forming complexes. The remaining 61.54% (16/26) was made up of other genes such as gyrA, gyrB, aph(3”)-llb, gibB, rpoC, PgsA, murA, fosA, folA, Arl, among others, distributed among the different families of antibiotics. Finally, in the virulence factors, mechanisms of action of adhesion, endotoxin (Waap), motility (fleN, FliD, fleQ, fliC, FlhB, fliP, fleR, flgL, pilX, pilU), biofilm (algA, algJ, algD) were identified. , algZ, algF, algU, algR), type II secretion system (LasA, LasB), type III secretion system (exoS, exoT, exoY) and protease (AprA), affirming what is described in the literature about P. aeruginosa, where it is classified as a multifactorial microorganism and whose mechanisms must be studied in depth since they are of utmost relevance for the health area.application/pdf50 páginasesPseudomonas AeruginosaMultirresistencia a FármacosMecanismos de ResistenciaFactores de VirulenciaCarbapenémicosThesisAcceso CerradoReconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0)Pseudomonas AeruginosaMultidrug ResistanceResistance MechanismsVirulence FactorsCarbapenems